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대장균(Escherichia coli) -. 대장균은 그람-음성 세균이다. 분자생물학의 많은 기본 원리는 세균과 그것을 감염시키는 바이러스의 유전학 연구에서 유래되었다. 세균의 구조, 생리, 생장에 대한 기본적인 지식은 이들의 유전학 연구에 반드시 필요하기 때문에, 세균에 대해 간단히 소개하도록 하겠다. 다른 모든 세포와 마찬가지로, 세균은 주변 환경과 세포질을 분리하는 세포막으로 둘러싸여 있다. 여러 겹의 펩티도글리칸(peptidoglycan, 다당류와 펩티드의 결합물)으로 이루어진 단단한 세포벽은 세포막을 둘러싸고 있다. 세포벽은 삼투압과 기계적 손상으로부터 세포를 보호하고, 일반적으로 구형, 막대형, 또는 나선형인 세균의 특징적인 모양을 갖도록 한다. 세균은 세포벽의 두께에 따라 2개의 주요 그룹으로 나눌 수 있는데, 덴마크의 세균학자인.. 2022. 8. 8.
세균의 염색질(chromatin) -. 박테리아 DNA는 핵양체 안에 있다. 닫힌 원형 구조의 대장균 DNA는 그 길이가 1,600 um(마이크로미터) 정도로서 0.5 um의 직경과 1 um 정도의 길이를 갖는 원통형 구조의 세포에 맞게 들어가야 한다. 따라서, 세포 내의 DNA는 유리된 DNA에 비해 1,000배 이상 응축된 구조를 나타내야 한다. 특정 단백질들이 DNA와 결합하여 세포 용적의 약 1/4을 차지 하는 핵양체(nucleoid)로 불리는 응축된 형태의 핵산 단백질 복합체를 형성한다. 세균의 염색질은 DNA 파괴나 단백질 변성을 초래하지 않는 세포 용해 기법을 통해 분리할 수 있다. 분리된 DNA는 고정된 양의 단백질과 가변적인 양의 RNA를 포함한다. 대개의 RNA는 대장균 염색질의 필수적인 부분이라기보다는 합성 초기 단계.. 2022. 8. 8.
거대분자 연구에 이용되는 물리적 기술들 -. 원심분리는 거대분자를 분리할 수 있으며, 거대분자의 크기와 형태에 대한 정보를 얻을 수 있다. 거대분자의 몇몇 중요한 특성들은 원심분리 영역에서 침전하는 속도를 측정하면 알 수 있다. 침전 연구는 일반적인 연구실 원심분리기로는 할 수 없다. 이는 확산에 의해서 무작위로 분자들이 위치하지 않도록 충분히 빠르게 분자들을 침전시키기 위한 원심분리 에너지를 일반적인 연구실 원심분리기가 만들어 낼 수 없기 때문이다. 그러나 최신 초고속 원심분리기의 경우 중력의 800,000배가 되는 에너지까지 만들 수 있는데, 이러한 힘은 용액 속에서 거대분자를 침전시키기에 충분하다. 분자의 침전 속도는 분자의 무게와 형태에 따라 달라진다. 만약 두 입자가 같은 모양을 가지더라도 하나의 분자량이 더 크면 분자량이 작은 것보.. 2022. 8. 8.
핵산의 분리 DNA 분리 방법은 해당 유기체에 적합하게 조절되어야 한다. 많은 분자생물학 실험에서 필수적인 단계인 DNA 분리는 관심이 가는 바이러스 또는 세포로부터 DNA가 분리되어 나오는 데서 시작되며 이때 흔히 단백질, RNA와 같은 다른 생체분자 물질도 같이 나온다. 유기체의 구조와 구성은 다양하기 때문에, DNA는 얻고자 하는 유기체에 따라서 DNA의 분리 방법이 달라져야 한다. DNA가 어떻게 감싸져 있는지와 DNA 건조 무게의 비율에 따라서 DNA 분리 방법을 선택해야 한다. DNA에 절단을 일으킬 수 있는 과도한 뒤섞임과 유체역학에 의한 전단력이 발생하는 방법들은 주의해야 한다. 다음은 바이러스, 세균, 플라스미드, 효모로부터 DNA를 분리하는 방법들이다. 1. 바이러스 DNA. 바이러스 입자가 녹아 .. 2022. 8. 8.
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